Остепененность кафедры составляет 100%.

На кафедре постоянно ведется  научная работа: в 1996 году   защитил докторскую диссертацию на тему «Хирургическая коррекция врожденных аномалий дистального отдела толстой кишки и промежности у детей» доц.  Вячеслав Владимирович Паршиков.

В 1997 году ассистент Евгений Степанович Малышев  защитил докторскую диссертацию на тему «Брефопластика костных полостей при хирургическом лечении хронического остеомиелита».

В 2000 году ассистент Н. Б. Киреева защитила кандидатскую диссертацию на тему «Органосохраняющие операции при заболеваниях и травмах селезенки».

В 2002 году ассистент Н. В. Козулина защитила кандидатскую диссертацию на тему «Комплексная оценка результатов хирургического лечения крипторхизма у детей».

В 2003 году ассистент И. Ю. Карпова защитила кандидатскую диссертацию на тему «Клиника, диагностика и лечение вторичного подострого оментита аппендикулярного генеза у детей».

В 2004 году аспирант Л. Р. Чардымова защитила кандидатскую диссертацию на тему «Коррекция анемии у детей с  хирургической патологией».

В 2005 году аспирант А.Л. Меликов защитил кандидатскую диссертацию «Лечение врожденных пороков развития передней брюшной стенки у новорожденных».

В 2006году аспирант Е.С. Кроль защитила кандидатскую диссертацию «Функция запирательного аппарата  прямой кишки после оперативной коррекции аноректальных аномалий».

В 2008 году доцент Н.Б.Киреева защитила докторскую диссертацию «Клинико-патогенетические обоснования эндоскопического и оперативного методов лечения пузырно-мочеточникового рефлекса у детей».

В 2008 году соискатель кафедры М.Ю.Заугаров защитил кандидатскую диссертацию «Эндоскопическая коррекция пузырно-мочеточникового рефлюкса у детей».

В 2009 году ассистент А.С.Железнов защитил кандидатскую диссертацию «Диагностика и лечение острого гематогенного остеомиелита у новорожденных».

Развита изобретательская деятельность - за последние 5 лет сотрудниками кафедры получено 17 патентов на изобретения.

Регулярно публикуются статьи и тезисы, в том числе, и в центральной печати.

Сотрудники кафедры регулярно выступают с научными докладами на конференциях, съездах и симпозиумах (Москва, Ростов-на-Дону, Казань, Воронеж, Пермь, Ульяновск, Смоленск, Уфа, Иркутск).

Научным направлением кафедры является реконструктивная хирургия пороков развития у детей. Новое развитие получила колопроктология, урология, хирургия новорожденных, видеоэндоскопическая хирургия. В настоящее время на кафедре проходят обучение аспиранты очного и заочного обучения, соискатели, клинические ординаторы, продолжает функционировать институт интернатуры. Успешно работает научный студенческий кружок. За это время выпущено 11 учебно-методических пособий по различным разделам детской хирургии.