Клиническими базами кафедры эндокринологии и терапии ФОИС являются ГКБ №13, ГКБ №5, МЧС ГУВД (клинический госпиталь ГУВД).

Муниципальное лечебно-профилактическое учреждение «Городская больница № 13» является самым мощным терапевтическим стационаром г. Нижнего Новгорода. Организационная структура учреждения представлена 24 клиническими отделениями, 10 вспомогательными (диагностическими и лечебными) медицинскими подразделениями, консультативной поликлиникой, административными, хозяйственной и прочими службами.

В структуре коечного фонда больницы – специализированные койки 25 клинических профилей для круглосуточного и дневного пребывания больных.

Муниципальное лечебно-профилактическое учреждение «Городская больница № 5» г. Нижнего Новгорода является многопрофильным терапевтическим и  хирургическим стационаром, включающий 6 терапевтических отделений (отделения кардиологии, неврологии,  терапии, ревматологии), 6 хирургических отделений (абдоминальной, торакальной и сердечно-сосудистой хирургии), а также клинико-диагностическое отделение, отделения реанимации и аптеку.  Больница оказывает ежедневно круглосуточно в течение всего года экстренную хирургическую и терапевтическую помощь населению города. Городская больница № 5 является мощной терапевтической базой для учебного процесса, позволяющей на современном уровне вести преподавание внутренних болезней.

Больница располагает современной диагностической и лечебной аппаратурой, в том числе эндоскопическим, ультразвуковым и рентгенологическими кабинетами.

На базе ГКБ №5 сформирован Городской нейрососудистый центр.

Сотрудники кафедры принимают участие во всех основных видах лечебной деятельности. Кафедра организует и участвует в научно-практических конференциях для врачей и мероприятиях для пациентов. Сотрудники кафедры участвуют в работе передвижного диабетологического модуля в рамках национального проекта «Здоровье».

Особое место занимает активная работа по новым диагностическим и лечебным  направлениям на клинических базах нашего города. Сотрудники кафедры, под руководством профессора  Стронгина Л.Г., стояли  у истоков применения  радиоактивного йода в лечении болезни Грейвса  в Нижнем Новгороде, проводили внедрение применения инсулиновых помп в лечении больных сахарным диабетом.