До 2006 года научным направлением кафедры была тема «Профилактика и лечение гнойно-воспалительных осложнений у больных с острой хирургической патологией».

С 2006 года кафедра работает над проблемой лечения деструктивных форм панкреатита.  Новизна исследований и полученные результаты:

• впервые разработан метод инфракрасной спектрометрии в диагностике и оценке тяжести острого панкреатита

• разработана рациональная схема применения современных антибиотиков при гнойных осложнениях.

• разработан и внедрен в клинику алгоритм рационального применения методов эфферентной терапии в лечении гнойных осложнений у больных с острой хирургической патологией.

• разработана методика ранней диагностики панкреонекроза и показания к хирургическому лечению.

С 1989 года сотрудниками кафедры опубликовано свыше 300 научных работ, защищено 2 докторских (еще 1 готова к защите) и 7 кандидатских  (еще 1 готовится к защите) диссертаций.

Данные, полученные в ходе научно-исследовательской работы, используются преподавателями кафедры в работе: лекции, семинары, конференции и пр.

Сотрудники кафедры ежегодно участвуют, выступают с докладами на пленумах симпозиумах и конференциях Всероссийского уровня (от 6 до 10 поездок в год). На кафедре успешно работает научный кружок студентов, что подтверждается 3 дипломами и двумя первыми премиями, полученных кружковцами на студенческих конференциях.