Большим достижением в области научных исследований явилась серия работ по клинике и диагностике дифтерийных кардитов и дифтерийных полиневропатий. Заметный вклад в развитие детской кардиологии внесла докторская диссертация Л.В.Казаковой, выполненная при совместном руководстве с проф. Л.Т. Стронгиным, посвященная диагностике диабетической кардиомиопатии у детей. Особое внимание уделяется изучению особенностей питания детей грудного возраста, а также отдаленные последствия питания детей неадаптированными молочными продуктами. Впервые в отечественной и мировой практике совместно с проф. М.П. Костиновым изучена клиническая и иммунологическая эффективность вакцинопрофилактики детей с иммунопатологическими состояниями.

Большим событием в жизни кафедры были организация Всероссийского семинара «Болезни миокарда у детей», посвященного памяти профессора Н.А.Белоконь в 2001 г., а также Всероссийского съезда детских  пульмонологов в 2007 г.

С 1991 года на кафедре подготовлено 4 докторских и  21 кандидатская диссертации. Сотрудники кафедры регулярно  выступают с докладами на Всероссийских и международных конференциях; за последние 10 лет опубликовано более 150 научных и учебно-методических работ, в том числе 5 монографий.