Преподавание общей хирургии или, как ее раньше называли, – пропедевтики хирургических болезней, на медицинском факультете Нижегородского университета началось в 1922 году. Кафедры, как таковой, тогда не было, и преподавание дисциплины проводилось на других хирургических кафедрах. Первым профессором по курсу общей хирургии был профессор К.К. Чачхиани (1922–29 г. г.), преподавание велось в 3 областной больнице (больница Красного Креста). В 1931 году за обучение по общей хирургии отвечал профессор В.И. Иост – заведующий кафедрой госпитальной хирургии.

Кафедра общей хирургии в качестве самостоятельной была создана в 1933 году, заведовал кафедрой профессор Д.П. Кузнецкий. Всего лишь один семестр она располагалась в Сормовской рабочей больнице (теперь больница № 12), а затем переехала в водную больницу. В 1940 году кафедру возглавил профессор И.Л. Цимхес. На кафедре работал ассистентом Н.И. Краковский, в последствии член-корреспондент АМН, один из пионеров отечественной ангиохирургии. С 1950 по 1952 год кафедрой заведовал блестящий хирург, профессор Н.Н. Блохин, будущий академик, президент АМН, создатель и директор Государственного онкологического центра. В 1952-1954 годах кафедрой руководил профессор Б.А. Королев, выдающийся кардиохирург, хирург-виртуоз, академик АМН. В 1954 году кафедра была переведена на базу хирургической клиники областной больницы им. Н.А. Семашко и возглавил кафедру профессор А.А. Ожерельев.

С 1956 года в течение 19 лет кафедрой и хирургической клиникой заведовал крупный хирург, видный онколог, талантливый диагност, заслуженный деятель науки РСФСР профессор А.И. Кожевников. Он заложил основы современного преподавания общей хирургии, в последующем его преемники лишь совершенствовали систему преподавания. Научной тематикой кафедры было хирургическое лечение различных онкологических заболеваний. Семь учеников А.И. Коженикова – И.Л. Ротков, В.И. Парахоняк, С.С. Нестеров, Ю.С. Силаев, Н.Е. Яхонтов, В.А. Овчинников, С.А. Касумьян – стали профессорами и заведующими кафедрами.

С 1975 года по 1988 кафедру возглавлял профессор В.И. Парахоняк, с 1988 по 1992 год – профессор В.А. Гагушин. С 1992 года кафедру возглавляет профессор В.А. Овчинников. Научные исследования хирургической клиники расширились, были внедрены в практику новые технологии неинвазивных методов диагностики и малоинвазивных видеохирургических оперативных вмешательств и вмешательств под контролем ультразвукового исследования. Коллективы кафедры и хирургической клиники являются единым целым, это и способствует успешному лечению больных.

В 1995 году кафедре и хирургической клинике присвоено имя А.И. Кожевникова.