Стоматологический факультет был открыт 1 сентября 1988 года. До открытия факультета в Нижегородской области укомплектованность здравоохранения кадрами врачей с высшим стоматологическим образованием составляла лишь 33,5% от необходимого числа. Стоматологическая помощь, в основном, оказывалась зубными врачами. Однако в стоматологических учреждениях города уже работали 4 кандидата медицинских наук: Киняпина И.Д., Черепенникова А.П., Чупрунова И.Н. и Лившиц Ю.Н., активно действовало научное стоматологическое общество под руководством И.Д. Киняпиной.

Идея открытия факультета была активно поддержана администрацией города и области. С целью улучшения условий преподавания на стоматологическом факультете администрация области выделила медицинской академии помещение для организации собственной учебной базы. Силами и средствами академии была проведена его реконструкция, оснащение, и в конце 1999 года состоялось открытие стоматологической клиники НГМА. Факультет получил дополнительно 45 современно оборудованных стоматологических рабочих мест, зуботехническую лабораторию, кабинет функциональной диагностики, операционную и рентгеновский кабинет. На каждой кафедре были оборудованы современные фантомные классы для самостоятельной работы студентов.

При открытии факультета большое внимание уделялось вопросу подготовки кадров. К преподаванию были привлечены наиболее высококвалифицированные врачи-стоматологи, имеющие высшую и первую квалификационную категорию. Семь молодых стоматологов из практического здравоохранения были направлены в целевую аспирантуру в Москву, Тверь и Казань, из  них 5 человек успешно защитили кандидатские диссертации и вернулись на факультет.

В 1988г. на первый курс стоматологического факультета было принято 100 студентов. Первым деканом стоматологического факультета с 1988 по 1993г. стала доцент Киняпина И.Д.

С 1993 года деканом стоматологического факультета стал профессор Жулев Е.Н., а в 1996г., в связи с реорганизацией управления Академии и объединением факультетов, деканом был назначен доцент Кузнецов А.Н.

С 2006г. деканом стоматологического факультета вновь стал д.м.н. профессор Евгений Николаевич Жулев – Отличник Здравоохранения, являющийся одновременно заведующим кафедрой ортопедической стоматологии. Фактически под его руководством идет формирование нижегородской школы стоматологов-ортопедов.

Весь двадцатилетний период развитие факультета шло при постоянном внимании и содействии ректората и Ученого совета медицинской академии. Сегодня факультет объединяет 8 кафедр: кафедру болезней уха, горла и носа; кафедру глазных болезней; медицинской физики и информатики; ортопедической стоматологии; патологической физиологии; стоматологии детского возраста; терапевтической стоматологии; кафедру хирургической стоматологии и челюстно-лицевой хирургии.

За время существования факультета на профильных кафедрах успешно завершили обучение в клинической ординатуре более 150 врачей.

В связи с расширением международной деятельности Академии на факультете организовано обучение студентов ФОИС на английском языке.

С самого начала организации факультета ведется большая работа по усовершенствованию качества преподавания, осваиваются новые методики проведения практических занятий, обновляются методические рекомендации. На каждой кафедре имеются музейные экспонаты, наглядные пособия, создан банк тестов и ситуационных задач для обучения и контроля знаний студентов. Кафедры обеспечены персональными компьютерами для проведения научных исследований и контрольного тестирования студентов.

На профильных стоматологических кафедрах активно работают студенческие научные общества. Студенты и сотрудники кафедр стоматологического факультета  участвовали и неоднократно занимали призовые места во Всероссийских стоматологических олимпиадах с международным участием. В 2005г. ассистенты кафедры ортопедической стоматологии - Горюнов С.Е и Якунина А.В., а в 2006г. ассистент кафедры хирургической стоматологии Н.А.Беспалова заняли призовые места во Всероссийском чемпионате стоматологического мастерства.

В жизни такого крупного высшего учебного заведения, как Нижегородская медицинская академия, 20 лет – это небольшой срок. Но за это время факультет утвердился, а его ведущие специалисты - ученые и практики получили заслуженное признание в России. Развитие факультета идет быстрыми темпами. Руководство факультета уверено, что выпускники нашего факультета займут достойное место в профессиональном сообществе врачей-стоматологов, и стоматологический факультет, как часть Нижегородской государственной медицинской академией -  одного из ведущих медицинских вузов России - войдет в плеяду лучших образовательных стоматологических учреждений нашей страны.