В 1919 году на базе Нижегородского университета оформилась организационно-медицинская группа, имевшая своей задачей подготовку врачей. За год группа переросла в медицинский факультет, который открылся 12 марта 1920 года. По формировании факультета на должность помощника декана и профессора оперативной хирургии и топографической анатомии избирается Аркадий Николаевич Куняев (1879-1921).

Он должен был начать читать курс на третьем курсе осенью; но весной этого года по поручению факультета А.Н.Куняев, заведуя небольшим анатомическим театром при губернской больнице, читал студентам курс описательной анатомии. А.Н.Куняев был прекрасным организатором, прекрасным лектором, быстро завоевавшим симпатии студентов, но первого августа он заболел сыпным тифом и в ночь с14 на 15 августа 1921 г. умер.

Следующим заведующим кафедрой стал профессор Л.П.Бибихин. Бибихин Леонид Петрович (1873–1932) окончил медицинский факультет МГУ в 1898 году.

В 1921-1928 годы был профессором кафедры ОХТА медицинского факультета НГУ. Кроме того, на 5 курсе читал факультативный курс под названием «Неотложная хирургия участкового врача».

С 1922 по 1954 год кафедру возглавлял Виктор Маркович Дурмашкин (1893–1960), принимавший непосредственное участие в организации медицинского факультета Нижегородского государственного университета им. Н.И.Лобачевского.

В 1937 г. – защита кандидатской диссертации, в 1946 г. - докторской диссертации на тему: «Принципы и техника первичных ампутаций» (первичные ампутации нижних конечностей в связи с морфологическими особенностями транспортных травм в 2 томах). Он автор оригинального труда по неотложной травматологии «Первичные ампутации конечности при размозжениях и отрывах». Один из первых хирургов произвёл операцию на сердце.

С 1952 г. до последних дней В.М.Дурмашкин работал профессором, заведующим отделением детской хирургии института травматологии и ортопедии. Им опубликовано более 50 научных работ по различным разделам общей хирургии и травматологии.

С 1954 по 1966гг. кафедру возглавлял заслуженный деятель науки, профессор Борис Васильевич Парин (1904–1968). С 1957 года Борис Васильевич являлся научным руководителем Горьковского научно-исследовательского института травматологии и ортопедии (ГИТО).

В 1966 году профессору Б.В.Парину было присвоено почетное звание заслуженного деятеля науки РСФСР.

За период научной деятельности Борисом Васильевичем опубликовано 216 научных работ, из них 5 монографий, посвященных различным вопросам пластической и реконструктивной хирургии. Кроме этого, под руководством профессора Б.В.Парина было выполнено 57 диссертаций, из них 12 докторских.

Вкладом профессора Б.В.Парина в отечественную хирургическую науку явилась разработка техники тридцати оперативных вмешательств в области урологии, грудной хирургии, в пластической и реконструктивной хирургии. Б.В.Парин был одним из ведущих специалистов по восстановительной хирургии. Широкую известность получили его методики ускоренной миграции Филатовского стебля, формирование круглых кожных стеблей большой величины, свободной кожной пластики и «послойным перфорированным лоскутом», фалангизация пястных костей у беспалых, радикального устранения синдактилии, пластического расщепления культи предплечья.

С 1966г. кафедра размещается в новом здании по ул. Медицинской 1а. Её заведующим с 1966 по 1991 год был заслуженный деятель науки РСФСР, профессор, Иван Филиппович Матюшин (1919–1994). Кафедра, которую возглавлял И.Ф.Матюшин, по отзывам ведущих специалистов (академиков В.В.Кованова, В.В.Куприянова, Лопухина А.П., член-корреспондента АМН СССР Островерхова и др.) являлась одной из лучших кафедр оперативной хирургии среди медвузов РСФСР.

И.Ф.Матюшин защитил кандидатскую (1954) и докторскую (1964) диссертации, создал научную школу с нетрадиционным направлением кардиохирургии, опубликовал более 150 научных работ, в том числе 3 монографии. В 1978 году был издан курс лекций по оперативной хирургии в двух томах, удостоенных диплома I-й степени МЗ РСФСР.

За большую организационную, учебно-воспитательную и научно-исследовательскую работу И.Ф.Матюшин награжден орденом "Знак почета", двумя орденами Трудового Красного Знамени, Знаком "Отличник высшей школы" и почетным знаком "Советского комитета ветеранов войны". В 1976 году ему присвоено почетное звание "Заслуженный деятель науки РСФСР".

С 1991 по 2011 годы кафедрой оперативной хирургии и топографической анатомии руководил проректор по учебной работе ГОУ ВПО НижГМА, профессор Геннадий Александрович Буланов. В это время на кафедре возродился операционный блок (в рамках центра по практическим хирургическим навыкам).

В 2011-2018 гг. кафедрой руководил д.м.н., профессор Сергей Николаевич Цыбусов.

С сентября 2018 г кафедрой заведует Андрей Владимирович Базаев

На кафедре оперативной хирургии в разные годы работали преподавателями известные ученые-хирурги: академики АМН Н.Н.Блохин и Б.А.Королев.

С 2009 г. На кафедре вновь начал свою работу студенческий кружок. Правда, основным направление кружка стало повышение уровня хирургических навыков. Начиная с 2011 г , на базе кружка создана сборная нашего ВУЗа по хирургическим навыкам. Члены сборной принимают участие в региональных и всероссийских олимпиадах по хирургии и смежным областям медицины (оперативная гинекология, детская хирургия, лапороскопическая хирургия, и др.) как в составе нашей команды, так и как «оперирующая часть» команд других кафедр. Многие бывшие кружковцы и члены сборной стали хирургами (например - Качесов А., Гусев Д., Никифоров П., Лузан Р., Антропова А., Валуев А. и многие другие).

В 2017 и 2018 гг. наша сборная два года подряд стала победителем Приволжского этапа Всероссийской олимпиады по хирургии и вышла в финал.