Кафедра является одной из старейших в вузе, была создана в 1920г., её возглавляли: сначала В.И. Крюкова, а затем П.С. Модератов. С 1934г. кафедрой стал заведовать профессор Федор Дмитриевич Агафонов, который был одним из инициаторов создания педиатрического факультета и длительное время – его деканом. В 1943г. проф. Ф.Д Агафонов организует кафедру госпитальной педиатрии, которой заведует до 1953г., а затем, в течение 10 лет, вновь возвращается к заведованию кафедрой детских болезней. Под его руководством выполнено 3 кандидатских и 1 докторская (Б.И. Гурвич) диссертации. Федор Дмитриевич являлся организатором и бессменным председателем Общества детских врачей, заместителем директора НИИ педиатрии по науке, членом правления Всероссийского общества детских врачей, членом редакционного Совета журнала «Педиатрия», награжден орденами Ленина и Красной Звезды.
С 1963 по 1992г. кафедрой детских болезней руководила профессор Зоя Александровна Спасская, которая явилась преемницей Ф.Д. Агафонова по работе в Горьковском и Всероссийском Обществе детских врачей. З.А.Спасская опубликовала более 100 научных работ, в том числе, учебно-методические пособия и сборники республиканского уровня, удостоена почетного звания «Заслуженный врач России». Под ее руководством подготовлено 11 кандидатских диссертаций.
С 1992 по 1995г. кафедру возглавлял профессор А.И. Волков – директор НИИ детской гастроэнтерологии, лауреат Государственной премии, член правления Общества детских гастроэнтерологов России, подготовивший в этот период 6 кандидатов наук, и опубликовавший более 125 работ, в том числе 2 монографии.
В 1995г. организована объединенная кафедра детских болезней (из кафедры детских болезней лечебного факультета и пропедевтики детских болезней), которую возглавил профессор В.В. Сафронов, с 1974г. руководивший кафедрой пропедевтики и занимавшийся изучением сердечно-сосудистой системы здорового и больного ребенка. Он принимал участие в создании первого отечественного эхокардиографа, разработке: ЭхоКГ-нормативов здоровых детей, критериев диагностики ревматизма, а так же методики исследования глубинных температур тела (СВЧ-радиотермометрия) и др. современных методик. В.В. Сафронов организовал и является до настоящего времени научным руководителем детского городского кардиоревматологического центра, им опубликовано более 160 научных работ, в том числе 2 монографии и 16 методических рекомендаций и пособий республиканского уровня, подготовлено 8 кандидатов и 1 доктор (Ю.Г. Кузмичев) наук. Виктор Владимирович был членом правления общества детской кардиоревматологии МЗ СССР, является членом правления Ассоциации ревматологов России, избран членом-корреспондентом Евро-Азиатской академии медицинских наук, удостоен звания «Заслуженный Врач РФ», награжден медалью «За доблестный труд», работал проректором по лечебной работе НижГМА и деканом педиатрического и медико-профилактического факультетов.
Ученик В.В. Сафронова профессор Ю.Г. Кузмичев является активным научным работником – им опубликовано более 260 научных работ, 1 монография, 10 методических рекомендаций, под его руководством подготовлены 14 кандидатов и 1 доктор наук (Е.П. Усанова). Награжден знаком «Отличник здравоохранения».
С августа 2006 года кафедру возглавляет доктор медицинских наук В.Н. Копейкин, активно работающий над проблемами детской гастроэнтерологии, им опубликовано 172 научные работы, в том числе различные разделы в 3 монографиях, и более 15 методических рекомендаций и пособий. В.Н. Копейкин является членом правления (педиатрическая секция) Российского общества эндоскопии пищеварительной системы, руководил и консультировал выполнение 6 кандидатских диссертаций.
Коллектив бережно хранит лучшие традиции, заложенные профессорами Ф.Д. Агафоновым, Б.И Гурвичем и другими руководителями кафедры.